Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18529 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18529 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18529 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18529 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18529 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18529 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18529 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18529 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18529 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18529 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18529 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18529 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18529 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18529 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18529 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18529 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18529 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms