Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim30aP15533 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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