Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp1P11103 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp1P11103 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms