Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxb4P10284 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms