Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Khdc1bP0C7A0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms