Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms