Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb7P09024 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb7P09024 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms