Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

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Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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