Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Me1P06801 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Me1P06801 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Me1P06801 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Me1P06801 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms