Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc4a1P04919 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc4a1P04919 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms