Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01728 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01728 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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