Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Copb2O55029 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms