Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stag2O35638 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stag2O35638 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms