Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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