Protein–RNA interactions for Protein: O35405

Pld3, Phospholipase D3, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld3O35405 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pld3O35405 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pld3O35405 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pld3O35405 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms