Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tnfrsf11aO35305 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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