Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ptpn9O35239 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms