Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Degs1O09005 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms