Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Flot1O08917 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Flot1O08917 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Flot1O08917 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Flot1O08917 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Flot1O08917 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Flot1O08917 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Flot1O08917 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms