Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms