Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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