Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm5225J3QPL3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm5225J3QPL3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm5225J3QPL3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm5225J3QPL3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm5225J3QPL3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm5225J3QPL3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm5225J3QPL3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm5225J3QPL3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm5225J3QPL3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm5225J3QPL3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm5225J3QPL3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5225J3QPL3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm5225J3QPL3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5225J3QPL3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm5225J3QPL3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5225J3QPL3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5225J3QPL3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5225J3QPL3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm5225J3QPL3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm5225J3QPL3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5225J3QPL3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5225J3QPL3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5225J3QPL3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5225J3QPL3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5225J3QPL3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5225J3QPL3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5225J3QPL3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5225J3QPL3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5225J3QPL3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5225J3QPL3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5225J3QPL3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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