Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim18J3QNP2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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