Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc180J3QNE4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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