Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms