Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms