Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms