Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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