Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms