Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10378F6XQQ1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms