Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms