Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap11-1E9Q2E9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms