Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms