Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Phf11bB4XVQ1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Phf11bB4XVQ1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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