Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms