Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms