Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apol7aB2RT54 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms