Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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