Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms