Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms