Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrit3W8DXL4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms