Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Top3bQ9Z321 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms