Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms