Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms