Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms