Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms