Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

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Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cpsf3Q9QXK7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cpsf3Q9QXK7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpsf3Q9QXK7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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