Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms