Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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