Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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